CONTRATACION POR LA FUNDACION PARA LA INVESTIGACION BIOMEDICA DEL HOSPITAL CLINICO SAN CARLOS DEL SERVICIO DE ANALISIS INTEGRADOS DE PERFILES METAGENOMICOS Y METABOLOMICOS PARA LA DETECCION DE BIOMARCADORES SERICOS DE MICROBIOTA EN CANCER COLORRECTAL (PA 11-26)

El contrato tiene por objeto el análisis integrado de perfiles metagenómicos y metabolómicos para la detección de biomarcadores séricos de microbiota en cáncer colorrectal. Este servicio se requiere para un proyecto de investigación de la Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Clínico San Carlos, subvencionado por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) y cofinanciado por la Unión Europea.

El contrato consiste en el suministro de reactivos para análisis de microbiota mediante secuenciación masiva, aplicando la metodología "Shotgun metagenomics" en un máximo de 550 muestras (tejidos, sueros y heces). Los reactivos deben ser compatibles con el equipo Nextseq 1000 (Illumina) del Laboratorio de Oncología Molecular del Hospital Clínico San Carlos de Madrid.

Los reactivos necesarios incluyen:

• Generación de librerías.
• Tagmentación.
• Secuenciación masiva de las muestras.
• Asesoramiento para el análisis e interpretación de resultados.

Las muestras séricas tienen bajo contenido de ADN, por lo que los reactivos deben asegurar el correcto análisis de estas muestras. Se requiere una resolución de 7,5 – 10 Gb por muestra para detectar todas las especies bacterianas.

El v...

El contrato entrará en vigor el día de su formalización.

El plazo total de ejecución es de 3 años, con posibilidad de prórroga de 1 año.

Fundación de Investigación Biomédica Hospital Clínico San Carlos (Provincia: Madrid)