SERVEIS ESPECIALITZATS DE BIOINFORMATICA PER PART D'UN CONTRACT RESEARCH ORGANIZATION (CRO) AMB EXPERIENCIA EN L'ANALISI DE DADES D'EPITRANSCRIPTOMICA GENERADES MITJANCANT TECNOLOGIA OXFORD NANOPORE DIRECT RNA SEQUENCING (DRNA-SEQ) EN EL MARC DEL PROJECTE DE RECERCA A-20926 "MAPPING M6A IN HTT1A TRANSCRIPTS USING OXFORD NANOPORE DIRECT RNA SEQUENCING IN HD MOUSE STRIATUM". L'OBJECTE DEL PRESENT CONTRACTE CONSTA D'UN UNIC LOT: - LOT 1: SERVEIS DE CRO PROJECTE A-20926 OBLIGATORIETAT DE LICITAR A TOT EL LOT. (F26.032CN)

El contrato consiste en la prestación de servicios especializados de bioinformática por parte de una Contract Research Organization (CRO) con experiencia en el análisis de datos de epitranscriptómica generados mediante la tecnología Oxford Nanopore direct RNA sequencing (dRNA-seq). Estos servicios se enmarcan en el proyecto de investigación A-20926, cuyo objetivo es mapear la metilación N6-adenosina (m6A) en los transcritos Htt1a utilizando la secuenciación directa de ARN de Oxford Nanopore en el estriado de ratones con la enfermedad de Huntington (HD).

El objeto del contrato consta de un único lote:

• Lote 1: Servicios de CRO Proyecto A-20926. El CRO deberá:
  • Realizar el control de calidad de los datos.
  • Llevar a cabo el basecalling.
  • Realizar el mapeo (mapping).
  • Realizar análisis de datos de Oxford Nanopore en formato Pod5.
  • Llevar a cabo procesos de basecalling, control de calidad y alineamiento a genomas personalizados.
  • Identificar y cuantificar modificaciones m6A mediante herramientas de IA/ML.
  • Analizar la coincidencia (overlap) con motivos DRACH para evaluar la especificidad de las modificaciones detectadas.
  • Cuantificar isoformas y analizar la correlación entre modificaciones m6A y el uso de isoformas.
  • Proporcionar apoyo científico durante la ejecución del pr...

El contrato se inicia con su formalización.

El contrato finalizará con el cierre del estudio y la entrega del informe final, y en todo caso, no finalizará más tarde del 28 de febrero de 2027, salvo interrupción anticipada por motivos de seguridad o causas de resolución, o modificación del plazo de ejecución. Se podrá modificar el plazo de ejecución del servicio hasta un máximo de 12 meses adicionales.

La totalidad del servicio se ejecutará en las instalaciones propias del Contract Research Organization (CRO) adjudicatario. (Provincia: Sin datos. El texto indica que la ejecución tendrá lugar en las instalaciones del CRO adjudicatario, pero no especifica su ubicación.)