SERVEIS DE SEQUENCIACIO EN PLATAFORMA ILLUMINA EN FUNCIO DE LES NECESSITATS PER AL PROJECTE PI24/00982 DE LA FUNDACIO DE RECERCA CLINIC BARCELONA - INSTITUT D'INVESTIGACIONS BIOMEDIQUES AUGUST PI I SUNYER (FRCB-IDIBAPS). (F26.009CN)

El contrato tiene como objeto la prestación de servicios de control de calidad, preparación de librerías y secuenciación de ARN y ADN mediante diferentes tecnologías a partir de material procedente de pacientes.

El contrato tiene un único lote, dividido en 2 sub-lotes:

• Sublote 1: Control de calidad, construcción de librerías y secuenciación del exoma completo (WES), con análisis primario de parte o de la totalidad del material secuenciado, en tejido tumoral.
• Sublote 2: Bulk RNA sequencing: construcción de librerías, secuenciación del transcriptoma completo (stranded mRNA-seq) y análisis primario de parte o de la totalidad del material secuenciado, en tejido tumoral.

El contrato se divide en dos sub-lotes:

• Sublote 1: Secuenciación del exoma completo (WES) en tejido tumoral
  • Control de calidad de las muestras (cuantificación fluorimétrica y análisis de integridad).
  • Reemplazo gratuito de las muestras que no pasan el control de calidad.
  • Kit de captura y librería: KAPA HyperExome (ROCHE) o equivalente/compatible.
  • Instrumento: NovaSeq 6000 (Illumina) o superior o instrumento equivalente.
  • Longitud de lectura: 2x150pb.
  • Cobertura: >200X.
  • Control de calidad de los datos y envío de FASTQ vía ftp.
  • Análisis primario de parte o de la totalidad de los ficheros FASTQ.
  • Requisitos de las muestras: >500ng total DNA, concentración entre 5-10ng/ul.
  • Tiempo de entrega de resultados: máxi...

La fecha de inicio del contrato es la de su formalización.

El contrato se iniciará con su formalización y finalizará el 31/12/2027, excepto modificación del plazo de ejecución.

Las instalaciones del adjudicatario. (Provincia: Barcelona)